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L’UMR 1272 créée par l’INSERM en 2019 regroupe tous les chercheurs en santé et biologie respiratoires de l’Université Sorbonne Paris Nord. Ses thématiques de recherche sont directement en lien avec les domaines d’excellence médicale/chirurgicale de notre hôpital universitaire (Hôpital Avicenne, APHP). La première thématique de recherche de l’unité concerne les Pneumopathies Interstitielles Diffuses, en particulier la Fibrose Pulmonaire Idiopathique et la sarcoïdose pulmonaire, pour lesquelles notre site a une expertise reconnue (labellisation comme Centre de Référence des Maladies Pulmonaires Rares de l’Adulte réseau ORPHALUNG, et Center of Excellence par la World Association of Sarcoidosis and Other Granulomatous disorders). Nos objectifs sont d’identifier les facteurs de progression du processus pulmonaire fibrosant et les mécanismes physiopathologiques/voies de signalisation impliqués afin de proposer de nouvelles stratégies thérapeutiques, grâce à des approches méthodologiques variées et volontiers interdisciplinaires (études cliniques/épidémiologiques de type exposome, études translationnelles, études expérimentales in vitro/in vivo, modélisation). La seconde thématique de recherche est l'étude des processus de réparation/régénération/remplacement des tissus pulmonaires au niveau alvéolaire et au niveau des grosses voies aériennes, en particulier le remplacement trachéal étendu, grâce à des approches de chirurgie innovante et ingénierie tissulaire in vitro/in vivo.
Axe principal
Epidémiologie et physiopathologie de pneumopathies fibrosantes - Régénération et remplacement des tissus pulmonaires
Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC)
N° d'équipe
Nom du directeur du laboratoire
Nom du responsable
Dr BARBRY Pascal
Courriel du responsable
Barbry@ipmc.cnrs.fr
Contacts principaux
Zaragosi Laure-Emmanuelle / zaragosi@ipmc.cnrs.fr
Adresse
660 Route des Lucioles
CP
06560
Ville
Valbonne Sophia-Antipolis
Pays
France
Téléphone
0493957759
Fax
Site internet
http://www.ipmc.cnrs.fr
Mots clés
Régénération de l'epithelium des voies respiratoires-Génomique fonctionnelle-Asthme-Mucoviscidose-BPCO-Single-cell-Human Cell Atlas
Résumé
Notre équipe étudie les mécanismes Moléculaires et Cellulaires qui régulent la régénération de l'epithelium des voies aériennes en condition physiologiques et pathologiques.
En complément d'approches de biologie cellulaire, nous utilisons des approches transcriptomiques, en RNAseq sur cellules uniques et transcriptomique spatiale.
Au sein d'un réseau international, nous contribuons au projet Human Cell Atlas qui vise à cartographier chaque cellule du corps humain.
Les infections par le Virus Respiratoire Syncitial (VRS) au cours des premières années de la vie sont associées à un risque accru d’asthme au cours de l’enfance. Il existe toutefois peu de données reliant les modifications des microbiomes respiratoire et digestif dans les suites d’une telle infection et les altérations de la fonction respiratoire qui en découlent.
Yagi et al. ont évalué au moyen d’un modèle murin, les modifications des microbiomes respiratoire et caecal dans les suites d’une infection à VRS à 7 jours de vie. L’analyse du microbiome était réalisée à 8 jours et à 4 semaines après l’infection des souris. En parallèle, une analyse de la fonction respiratoire et une analyse histologique du poumon était réalisée 4 semaines après l’infection.
Les auteurs rapportent ainsi une évolution différente entre les 2 microbiomes. Ainsi, à 8 jours, l’analyse du microbiome respiratoire des souris VRS+ montrait une augmentation de l’abondance relative en Staphylococcus et en Streptococcus comparativement au groupe contrôle. Cette différence se corrigeait à 4 semaines. A l’inverse, alors que le microbiome caecal chez les souris VRS+ était similaire à celui des souris contrôles à J8, les auteurs rapportent, à 4 semaines post-infection, une diminution de la diversité et une diminution de l’abondance relative en Ruminococcaceae.
En parallèle de ces modifications de microbiome, les souris infectées présentaient à 4 semaines une production accrue de mucus, et une diminution de leur fonction respiratoire (capacité inspiratoire, capacité vitale et compliance pulmonaire).
Enfin, les auteurs ont analysé l’impact d’un traitement par Ampicilline débuté 8 jours après la date d’infection. A 4 semaines, les souris traitées par Ampicilline (Ampi+/VRS- ou Ampi+/VRS+) présentaient des modifications de leur microbiome caecal similaires à celles des souris VRS+ précédemment décrites. De la même manière, les souris Ampi+/VRS- présentaient également une altération significative de leur fonction respiratoire comparativement aux souris contrôles.
Bien que les mécanismes précis expliquant la relation entre microbiome et fonction respiratoire ne soient pas encore élucidés, la réduction de la biodiversité et le déséquilibre du microbiote caecal semblent jouer un rôle dans cette relation.
Damien Basille, Service de Pneumologie et Unité de Soins Continus Cardio Thoracique Vasculaire et Respiratoire, Centre Hospitalier Universitaire Amiens-Picardie, 80054 Amiens, France
D’après la communication de Yagi K. et al. : The impact of the microbiome on pathophysiology following early-life respiratory syncytial virus infection. Am J Respir Crit Care Med 2023; 207 : A5617 (session C66).