2023 est-elle l’année de tous les « omiques » pour l’ATS ?

Après l’effervescence liée au séquençage du génome humain au tournant de ce millénaire, les milieux scientifiques ont vu émerger successivement lors des trois dernières décennies différentes approches dites « globales » dont l’appellation se termine par le terme « omique », où le suffixe « ome » vient du sanscrit et signifie « totalité », et non du grec « ôma » terme habituellement utilisé pour désigner une tumeur.

Très vite, l’on s’est rendu compte que l’étude, même exhaustive, d’un système biologique isolé du contexte global du corps humain dans son environnement ne peut donner que des résultats parcellaires. Ainsi, la cartographie du génome humain n’a que peu d’intérêts si l’on ignore les produits intermédiaires (ARN messagers) ou finaux (protéines) dérivés des gènes grâce à la transcriptomique et à la protéomique. Pareillement, l’identification isolée d’une protéine d’intérêt, sans en connaître les métabolites (grâce à la métabolomique) et l’influence d’expositions environnementales particulières (exposome) sur la dynamique de ces métabolites n’aura aucune utilité en pratique. C’est pour cela qu’il convient désormais de combiner les différentes approches dites « omiques » en utilisant les mégadonnées (ou Big Data) qu’elles génèrent et utiliser l’intelligence artificielle comme outil d’analyses pour avoir enfin une approche non seulement globale mais surtout intégrative et pertinente des maladies respiratoires. Ainsi plusieurs sessions au cours des 4 journées du Congrès de l’ATS 2023 vont être consacrées à cette stratégie « multi-omique » pour l’étude de l’asthme (sessions A25, B9, B101, C6, D85, L27), la BPCO (sessions A6, B9, B101, B107), l’hypertension pulmonaire (sessions A14, A97, B89, C26, D8), la fibrose pulmonaire (sessions A16, A68, B101, C28, C86), l’apnée du sommeil (session B109), les pneumopathies infectieuses (D17) et le cancer bronchique (D98).


Anh Tuan Dinh-Xuan, Service de Physiologie-Explorations Fonctionnelles, Hôpital Cochin, 27, rue du faubourg Saint-Jacques, 75014 Paris

D’après les sessions :
A6: Beyond transcriptomics: the next frontier in COPD/emphysema.
A14: This is getting complicated: epigenetics, -omics, and cell signaling in pulmonary hypertension.
A16: Interrogating genomic, transcriptional, and epigenetic mechanisms in lung fibrosis.
A25: Omics and the exposome: high dimensional methods in environmental lung health research.
A68: Mitochondrial and metabolomic alterations in the pathogenesis of ILDs.
A97: Rise of the machines: -omics and computational biology in pulmonary hypertension
B9: Sex-specific mechanisms of lung disease pathogenesis through the lens of single cell RNA sequencing.
B89: Transcriptomic profiling of pulmonary vascular lesions unravel mechanisms of pulmonary arterial hypertension.
B101: Omics studies of immune cells and the lung
B107: COPD: from omics to treatment.
B109: Biomarkers, genetics, and omics in sleep disordered breathing.

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