Repenser la prise en charge des infections respiratoires 

Louise Bondeelle, service de Pneumologie, Hôpitaux universitaires de Genève, Suisse

Microbiote, phagothérapie et métabolites : cette session a décrit de nouvelles perspectives de stratégies thérapeutiques dans les infections respiratoires

La thérapie par bactériophages utilisant des virus lytiques comme antimicrobiens, est désormais un outil disponible et sûr pour traiter certaines infections pulmonaires multirésistantes notamment chez les patients atteints de mucoviscidose. Les études cliniques restent limitées mais ont montré une diminution de la densité de Pseudomonas dans les expectorations, sans modifier le microbiote global mais sans non plus modifier significativement la fonction respiratoire. A ce jour, il n’existe pas de consensus sur la durée, la voie d’administration (inhalée ou autre) et la dose optimale des phages. Des essais standardisés et multicentriques sont en cours pour mieux définir les protocoles thérapeutiques et évaluer leur efficacité clinique.

Parallèlement, les métabolites issus du microbiote intestinal et pulmonaire jouent un rôle clé dans la genèse des pathologies respiratoires. Des données expérimentales montrent qu’une antibiothérapie donnée à un âge très précoce perturbe la maturation du microbiote et réduit des métabolites protecteurs, favorisant le développent d’allergies et d’asthme.

Le rôle du microbiote respiratoire

Au-delà des pathogènes pro-inflammatoires, certaines bactéries des voies aériennes semblent associées à un profil un profil inflammatoire plus faible et pourraient exercer une activité anti-inflammatoire directe. Cela ouvre des perspectives de stratégies thérapeutiques reposant sur la modulation ciblée du microbiote respiratoire.

Enfin, Aspergillus produit de l’acide oxalique pour modifier le pH pulmonaire et faciliter l’infection. Des travaux montrent que des bactéries capables de dégrader cet acide peuvent freiner la croissance fongique et atténuer l’atteinte pulmonaire dans certains modèles. Cette stratégie illustre une nouvelle approche visant à rendre l’environnement respiratoire moins favorable au développement du champignon.


D’après la session Hot topics Big changes on a small scale: microbiome-targeted therapies for prevention and treatment of respiratory diseases Translational
PMID: 40301561 : Personalized inhaled bacteriophage therapy for treatment of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis
PMID: 39013465 : Antibiotic-driven dysbiosis in early life disrupts indole-3-propionic acid production and exacerbates allergic airway inflammation in adulthood
PMID: 39395980 : Aggregatibacter is inversely associated with inflammatory mediators in sputa of patients with chronic airway diseases and reduces inflammation in vitro


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